← Back to CoursesStemExpert
StemExpert
Expert · Werkboek · 30. Biotechnologie en genetische technieken
StemExpert · Brecht Corbeel · schoolium.me
StemExpert
E30. Biotechnologie en genetische technieken — werkboek
EExpert · deel E6 · Life sciences en bio-engineering

Werkboek · hoofdstuk 30Biotechnologie en genetische technieken

DNA verbinden, versterken en meten met een controleerbare betekenis

Je rekent eerst lengte, richting en versterking, daarna kalibratie en monsterkans. Je eindigt met een geldig watertestrapport en een onderbouwde technische en maatschappelijke afweging.

4× oefenen4× toepassen4× uitdagen± 505 min0/12 gedaan
BLeven en systemenWWiskundig modelleren
Een snel signaal wordt bruikbaar door monstergegevens, kalibratie en werkende controles.
Een snel signaal wordt bruikbaar door monstergegevens, kalibratie en werkende controles.
Hoe lees je een opdracht?
Drie tredenOefenen Toepassen Uitdagen

Elk hoofdstuk bouwt op: eerst oefenen (één stap, direct toepassen), dan toepassen (meerdere stappen, in een context), dan uitdagen (transfer, open problemen, andere leerlijnen erbij).

De StemExpert-schaal5

Eén moeilijkheidsschaal van 1 tot 9 over de drie niveaus heen: Fundamental loopt van 1 tot 4, Intermediate van 3 tot 7, Expert van 6 tot 9. Zo zie je dat de uitdaging van het ene niveau de oefening van het volgende is.

Oefenen

Oefenen

één stap, direct toepassen
30.1

Een vectorlengte

Oefenen6Rekenen25 min
Vector 3600 bp; verwijder 200 bp en voeg 800 bp in.
  1. a
    Bereken eindlengte en wat een correcte som van knipfragmenten wel/niet bewijst.
30.2

Primer richting

Oefenen6Begrijpen25 min
Referentiebinding aan rechterzijde 5′-TTGACCAA-3′.
  1. a
    Geef de reverse-primer 5′→3′ en de verlengingsrichting in het schema.
30.3

Efficiëntie gebruiken

Oefenen6Rekenen25 min
N0=5, ε=0,8, 10 cycli.
  1. a
    Bereken kopieën en vergelijk met ideaal verdubbelen.
30.4

Gel lezen

Oefenen6Begrijpen25 min
Monster A heeft een band bij 300 bp, NTC heeft geen zichtbare band.
  1. a
    Geef twee gerechtvaardigde en twee te sterke conclusies.
Toepassen

Toepassen

meerdere stappen, in een context
30.5

Ct en factor

Toepassen7Rekenen25 min
Geldige exponentiële assay met factor 2; monster A Ct20 en B Ct23.
  1. a
    Vergelijk beginhoeveelheden en verklaar wat gelijk moet zijn.
30.6

Logaritmische gelinterpolatie

Toepassen7Rekenen25 min
300 bp op 42 mm en 1200 bp op 22 mm; onbekend op 32 mm.
  1. a
    Bereken lokale lengte en een belangrijk voorbehoud.
30.7

Een target gemist

Toepassen7Rekenen25 min
C=0,2 kopie/mL, V=50 mL, recovery 0,5, aliquotfractie 0,1.
  1. a
    Bereken λ en de ideale kans op minstens één target; wat als interne controle faalt?
30.8

Een nul-telling begrenzen

Toepassen7Rekenen25 min
Geldige ideale detectie; Vrf=10 mL, nul targets.
  1. a
    Bereken eenzijdige 95%-bovengrens en formuleer de conclusie.
Uitdagen

Uitdagen

transfer, open problemen, leerlijnen combineren
30.9

Een volledige modelrun

Uitdagen9Programmeren75 min
testmodel.py geeft efficiëntie, residuen en een onbekend Ct 25.
  1. a
    Reproduceer getallen en voer herstel/fractie/efficiëntiegevoeligheid uit; geef geldige rapportvelden.
Zo wordt dit beoordeeld
techniekRichting, model en controles zijn correct.
grenzenSamplevolume, herstel, detectie en identiteit worden onderscheiden.
besluitEen signaal wordt niet zonder validatie een veiligheidsvrijgave.
30.10

Cas9-resultaat beoordelen

Uitdagen9Analyseren60 min
Een kniptest is positief; de beoogde reparatie ontbreekt in veel geanalyseerde cellen.
  1. a
    Geef een mechanistische verklaring en een toetsplan voor een functionele uitspraak.
Zo wordt dit beoordeeld
techniekRichting, model en controles zijn correct.
grenzenSamplevolume, herstel, detectie en identiteit worden onderscheiden.
besluitEen signaal wordt niet zonder validatie een veiligheidsvrijgave.
30.11

Habitat monsterplan

Uitdagen9Habitat90 min
Een 500 L-drinkwatertank heeft één snelle targetniet-detectie zonder vastgelegd samplevolume.
  1. a
    Ontwerp een reviewbaar monster-/controle-/rapportplan en herstel de te sterke conclusie.
Zo wordt dit beoordeeld
techniekRichting, model en controles zijn correct.
grenzenSamplevolume, herstel, detectie en identiteit worden onderscheiden.
besluitEen signaal wordt niet zonder validatie een veiligheidsvrijgave.
30.12

Biotechnologie afwegen

Uitdagen9Argumenteren80 min
Een koudegewasvoorstel gebruikt een aangepaste regulerende sequentie; een bestaande andere cultivar is alternatief.
  1. a
    Maak een beslismatrix met bewijs, baten, gevolgen en verantwoordelijkheid.
Zo wordt dit beoordeeld
techniekRichting, model en controles zijn correct.
grenzenSamplevolume, herstel, detectie en identiteit worden onderscheiden.
besluitEen signaal wordt niet zonder validatie een veiligheidsvrijgave.
ZelfevaluatieKleur per doel: lukt al / bijna / nog niet